(三)
洪武十五年(1382)正月一日，在謹身殿大宴群臣，開始用九奏樂。景川侯曹震、定遠侯王弼攻下威楚路。二日，元曲靖宣慰司以及中慶、澄江、武定各路全部投降，雲南於是平定。九日，減少死罪囚犯。十五日，在南郊隆重祭祀天地。二月二日，命令天下朝覲官各舉薦一人。四日，黃河在河南決口，駙馬都尉李祺受命賑饑。六日，詔諭天下：雲南已經平定。閏二月二十三日，藍玉、沐英攻克大理，接著分兵巡迴鶴慶、麗江、金齒，各地俱下。三月二十一日，黃河在朝邑決口。
四月五日，將元朝梁王把匝剌瓦兒密及威順王的兒子伯伯的家屬遷到耽羅。七日，詔諭天下一律祭祀孔子。十日，免除京畿、浙江、江西、河南、山東的稅糧。五月十七日，建成太學，隆重祭祀先師孔子。二十八日，廣平府官吏王允道奏請發展磁州冶鐵業。朱元璋說“：我只聽說當帝王的人要使天下沒有遺漏的賢人，而沒有聽說要使天下沒有遺漏的利益。現在，兵器不缺，而且民眾安定，此事對國家無益，只能騷擾人民。”將王允道施杖刑後，流放嶺南。二十九日，派遣行人探訪賢哲之士。
七月八日，黃河在滎澤、陽武決口。十二日，罷免了四個輔官。八月一日，傅友德、沐英擊敗烏撒蠻。三日，恢復科舉，三年一次，作為制度。十二日，皇后死去。十五日延安侯唐勝宗、長興侯耿炳文在陝西屯田。二十三日，提升秀才曾泰為兵部尚書。二十七日，告示天下選拔秀才要分六科考試。九月三日，吏部將鄭韜等三千七百多賢哲之士引見給皇帝，並令他們舉薦所知人才，立即派人徵召。賞賜鄭韜等人錢鈔，不久又分別授予布政使、參政等不同的官職。二十四日，將孝慈皇后葬在孝陵。
十月一日，設定都察院。二十一日，審查囚犯罪狀。十一月十三日，徐達還京。當月，平定廣東群盜，詔趙庸撤軍。二十六日，設定殿閣大學士，讓邵質、吳伯宗、宋訥、吳沉擔任。十二月十七日，賑濟北平受災的屯田士兵。二十五日，永城侯薛顯料理山西軍務。
這一年有爪哇、琉球、烏斯藏、占城前來朝貢。
洪武十六年(1383)正月十一日，在南郊隆重祭祀天地。十四日，徐達鎮守北平。二月二十二日，要天下各學校每年要向京師輸送人才。三月一日，召南征軍隊回師，沐英留守雲南。二十三日，返還鳳陽、臨淮兩縣百姓的徭賦，以後世代不貢。
五月十七日，免除京畿各府的田租。六月十九日，免除京畿十二州縣養馬人戶的田租一年，免除滁州養馬戶田租二年。
七月，派遣御史審查囚犯罪狀。八月一日，日食。九月二十三日，申國公鄧鎮被封為徵南將軍，討伐龍泉山賊寇，並予以平定。
十月七日，召回徐達。十二月二十五日刑部尚書開濟犯罪被殺。
這一年，琉球、占城、西番、打箭爐、暹羅、須文達那前來朝貢。
洪武十七年(1384)一月九日，在南郊隆重祭祀天地。十日，徐達鎮守北平。二十四日，湯和巡視沿海諸城，防禦倭寇。三月一日，頒佈科舉考試的格式。曹國公李文忠死去。二十七日，大赦天下。
四月十五日，對平定雲南的將士論功，封傅友德潁國公，陳桓等四人為侯，大賞將士。十八日，收殮陣亡將士遺骸。擴建國子學學舍。五月二十九日，涼州指揮宋成討伐西番，在亦集乃將其擊敗。
七月二日，禁止內官干預國事，並傳文告示各司不準與內官交往。十七日，詔諭百官，有迎接養父母的，官府供給車船。二十一日，免除京畿內當年的一半田租。二十四日，審查囚犯罪狀。二十六日，有一個盱眙人進獻天書，被斬首。八月一日，黃河在開封決口。七日，杞縣黃河決口，派遣官吏堵塞大堤。二十四日，免除河南諸省拖欠的賦稅。
十月十二日，河南、北平發生水災，派遣駙馬都尉李祺等人整治。閏十月十九日，告示對天下囚犯，必須由刑部、都察院詳細審查，由大理寺反覆審判後上奏判決。當月，召回徐達。十二月十九日，免除雲南拖欠的賦稅。這一年，琉球、暹羅、安南、占城前來朝貢。
洪武十八年(1385)正月初九，在南郊隆重祭祀天地。十一日，對朝覲官分成五等進行考查，罷黜升遷各有不同。二月十二日，由於連連陰雨、打雷下冰雹，要臣民幫助檢舉過失。二十七日，魏國公徐達死去。三月十一日，賜給丁顯等人進士及第以及其他不同的出身。詔諭國內外官員之父母死在其任職之地，有司供給車船送回安葬，並定為制度。十四日，免除京畿內當年田租。命天下各郡縣埋葬暴露在外的屍骨。十五日，初次選出的進士擔任翰林院、承敕監、六科庶吉士。二十八日，戶部侍郎郭桓坐盜官糧，被誅殺。
四月六日，吏部尚書餘火氣犯罪被誅。二十五日。思州蠻叛亂，湯和被封徵虜將軍，周德興擔任副將軍，率兵跟隨楚王朱楨討伐叛軍。六月十八日，規定外地官員三年進京朝見一次，並定為制度。
七月十四日，封王礻禺為高麗國王。二十日，五開蠻反叛。八月二十一日，馮勝、傅友德、藍玉在北平四周守備。當月，賑濟河南水災。
十月一日，釋出《大誥》。十五日，召回馮勝。十六日，下詔書說：“孟子傳道，功績卓著。經過了這麼多年，其子孫後代甚少。近來有一些以罪輸作者，豈是尊敬先賢的道理。必須著意探訪，凡是聖賢的後代輸作，皆釋免。”當月，楚王朱楨、信國公湯和平定了五開蠻叛亂。十一月十七日，免除河南、山東、北平的田租。十二月十九日，下詔要有司舉薦孝廉。二十六日，麓川平緬宣慰使思倫發反叛，都督馮誠被打敗，千戶王升戰死。這一年，有高麗、琉球、安南、暹羅前來朝貢。
洪武十九年(1386)正月四日，賑濟大名以及江浦的水災。七日，在南郊隆重祭祀天地。當月，徵蠻軍隊回師。二月十日，耕耘耒昔田。二十七日，賑濟河南饑荒。
四月十九日，詔令贖下河南饑民要吃的小孩。六月二十日，詔令有司撫卹慰問年紀大的人。貧民年紀在八十以上，每月給五斗米、三斤酒、五斤肉；九十歲以上的，每年加帛一匹，棉花一斤；有田產的人不給米。應天、鳳陽的富裕人，八十歲以上賜封爵社士，九十歲以上封為鄉士；其他地方富民八十歲以上為裡士，九十歲以上為社士。都與縣官同禮，免除全家徭役。鰥寡孤獨不能生活的，一年給米六石。士兵在戰場上負傷的，免除兵役以及三年徭役。軍官陣亡，其子世襲並加一級俸祿，對隱居之士，以禮相聘。二十三日，賑濟青州和鄭州的饑荒。
七月二十九日，詔令舉薦各種人才。六十歲以上的，擔任翰林院顧問；六十歲以下的，在六部、布按二司任職。三十日，命皇太子在泗州、盱眙修建祖陵，將德祖以後皇后的衣冠葬於此陵。九月七日，在雲南屯田。
十月，詔令給子女幼年或父母年老的已亡官兵照發全部俸祿。並定為制度。十二月一日，有日食。當月，命令宋國公馮勝派兵防禦邊疆。派遣河南、北平、山東、山西百姓往大寧運糧。這一年，有高麗、琉球、暹羅、占城、安南前來朝貢。
洪武二十年(1387)一月二日，馮勝被封為徵虜大將軍，傅友德、藍玉為副將軍，率兵征伐納哈出。焚燬錦衣衛刑具，將囚犯押往刑部。十三日，在南郊隆重祭祀天地。祭祀結束，天氣轉好。侍臣讚美說“：這是陛下誠心敬天所至。”朱元璋說“：所謂敬天，不僅要有莊敬、有禮之形式，還要實際的東西。天將管理子民的大任交給君王，為君的，若想侍奉上天，必須首先體恤萬民。體恤萬民，才是事天之實。就像國家派去擔任太守縣令等官的人一樣，若不能造福於民，則未完成君王交給的使命，這是大不敬啊。”又說“：為萬民之君的人，天為父，地為母，民為子，應盡各種職責，祭祀天地，並非為自己祈福，而是為了天下萬民。”二月一日，觀看軍隊操練。十四日，耕耘耒昔田。三月一日，馮勝率兵出松亭關，攻克大寧、寬河、會州、富峪。
四月八日，江夏侯周德興在福建沿海修築城防，抵禦倭寇。六月二十二日，臨江侯陳鏞率軍出征，迷失方向，全軍覆沒。二十五日，馮勝率兵越過金山。二十九日，納哈出投降。閏六月十二日，回師停留金山，都督濮英率兵殿後，遇到伏擊，戰死。
八月二十六日，沒收馮勝將軍印，並將其召回，藍玉主管軍中事務。景川侯曹震在雲南品甸屯田。九月一日，封納哈出為海西侯。六日，設定大寧都指揮使司。二十日，安置鄭國公常茂於龍州。三十日，封藍玉為徵虜大將軍，延安侯唐勝宗、武定侯郭英為副將軍，北征沙漠。當月，攻克西寧。
十月一日，封朱壽為舳艫侯，張赫為航海侯。當月，將馮勝罷免送回鳳陽，奉詔才去朝見。十一月六日，普定侯陳桓、靖寧侯葉升在定邊、姚安、畢節各衛屯田。八日，湯和返回，共築寧海、臨山等五十九處城防。十二月，賑濟登、萊饑荒。
這一年有琉球、安南、高麗、占城、真臘、朵甘、烏斯藏前來朝貢。
洪武二十一年(1388)正月六日，麓川蠻思倫發進攻馬龍他郎甸，都督寧正將其擊敗。十六日，在南郊隆重祭祀天地。十九日，賑濟青州饑荒，逮捕懲治有司中隱匿上報飢災文書的人。三月一日，封賜任亨泰等進士及第以不同的出身。十二日，賑濟東昌饑荒。三十日，沐英討伐思倫發，將其擊敗。
四月十二日，藍玉打敗元嗣君王於捕魚兒海，俘獲其次子地保奴及妃主王公以下幾萬人後返回。五月一日，日食。六月二日，信國公湯和迴歸鳳陽。二十二日，封傅友德為徵南將軍，沐英、陳桓為左、右副將軍，率兵討伐東山叛蠻。
七月六日，將地保奴安置到琉球。八月十二日，將澤、潞無業百姓遷至黃河兩邊開墾土地，賞給錢鈔，為其發放農具，免賦稅三年。二十六日，藍玉回師，對北征將士大加賞賜。二十七日，封孫恪為全寧侯。當月，皇帝親自制定八諭告誡武臣。九月十五日，秦、晉、燕、周、楚、齊、湘、魯、潭九王來京朝拜。二十二日，越州蠻阿資叛亂，沐英與傅友德同往討伐。
十月七日，東川蠻被平定。二十四年升封藍玉為涼國公。這一年有高麗、占城、琉球、暹羅、真臘、撒馬兒罕、安南前來朝貢。下詔要安南三年朝貢一次，像犀之類的東西不要進獻。安南黎季睺殺掉其主煒。
洪武二十二年(1389)正月十六日，將大宗正院改為宗人府，讓秦王朱..擔任宗人令，晉王朱木罔、燕王朱棣為左、右宗正，周王朱木肅、楚王朱楨為左、右宗人。十七日，在南郊隆重祭祀天地。二十五日，傅友德在普安擊破阿資。二月二十日，藍玉在四川練兵。二十三日，禁止武臣參與地方事務。二十四日，湖廣千戶夏得忠勾結九溪蠻叛亂，靖寧侯葉昇平定叛亂，夏得忠伏誅。當月，阿資投降。三月一日，傅友德率諸將駐紮四川、湖廣，防禦西南蠻。
四月一日，遷徙江南人到淮南，發給錢鈔和農具，免徵三年賦稅。五月十五日，魏國公徐允恭、開國公常開等在湖廣練兵。十六日，將元降王遷至眈羅。當月，派御史審查山東隱匿災情不報的官吏。五月二十三日，在兀良哈設定泰寧、朵顏、福餘三衛。
七月，傅友德等返回。八月二十日，詔令全國推薦德高望重又洞悉時務的長者。當月，更定大明律。九月一日，日食。
十一月二日，宣德侯金鎮等在湖廣練兵。十五日，思倫發朝貢謝罪，於是麓川平定。十二月十日，周王朱木肅犯罪，遷雲南，不久免遷，仍留居京師。定遠侯王弼等在山東、河南、陝西練兵。這一年有高麗、安南、占城、暹羅、真臘前來朝貢。元也速迭兒殺其君主脫古思帖木兒另立坤帖木兒。高麗廢君主礻禺，接著又廢君主昌。安南黎季睺殺害其主日火昆。
洪武二十三年(1390)一月三日，晉王木岡、燕王棣率兵征討元朝丞相咬住、太尉乃兒不花，徵虜前將軍潁國公傅友德等皆聽其節制。十五日，在南郊隆重祭祀天地。十六日，貴州蠻叛亂，延安侯唐勝宗平定叛亂。六日，齊王..率兵跟隨燕王棣北征。贛州賊寇作亂，東川侯胡海擔任總兵官，普定侯陳桓、靖寧侯葉升為副將，將其平定。唐勝宗督促貴州各衛屯田。二月十四日，藍玉平定西番蠻的叛亂。二十二日，耕種耒昔田。二十九日，黃河在歸德決口，發動各地軍民堵塞。三月三十日，燕王軍隊停留迤都，咬住等人投降。
四月，吉安侯陸仲亨等人被胡惟庸一案連坐下獄。三日，潭王梓自焚而死。閏四月十四日，藍玉平定施南、忠建蠻的叛亂。五月二日，將各公侯遣回故里，分別賞賜金錢。二十三日，將太師韓國公李善長賜死，陸仲亨等人連坐被殺。作《昭示奸黨錄》，並公告天下。六月四日，藍玉派鳳翔侯張龍平定都勻、散毛諸蠻。二十九日，給有才德、知典故的老人授官。
七月二日，黃河在開封決口，進行整治。三日，崇明、海門風雨成災，海潮氾濫，派遣官吏治理，並徵集二十五萬民工築堤。八月十三日，詔令禁止以官吏、兵士充當選舉。藍玉返回。當月，賑濟河南、北平、山東水災。九月一日，日食。
十月二十一日，賑濟湖廣饑荒。十一月二十五日，免除山東受災之地的田租。規定凡是斬首以下的囚犯到北方邊疆種植，交粟贖罪。十二月五日，停止天下織造文綺。
這一年，墨剌、哈梅里、高麗、占城、真臘、琉球、暹羅前來朝貢。
洪武二十四年(1391)正月十五日，在南郊隆重祭祀天地。二十日，潁國公傅友德被封為徵虜大將軍，定遠侯王弼、武定侯郭英為副將軍，守備北平四周。二月十五日，免去山東田租。二十九日，耕種耒昔田。三月一日，日食。魏國公徐輝祖、曹國公李景隆、涼國公藍玉守備陝西邊疆。八日，靖寧侯葉升在甘肅練兵。十日，封賜許觀等人以進士及第等不同出身。
四月十四日，封皇子朱木旃為慶王，朱權為寧王，朱木便為岷王，朱木惠為谷王，朱松為韓王，朱模為沈王，朱楹為安王，朱逪為唐王，朱棟為郢王，朱木彝為伊王。二十六日，燕王朱棣率傅友德諸將出塞，敗敵而歸。五月十二日，漢、衛、谷、慶、寧、岷六位王公在臨清練兵。六月四日，詔令廷臣參考歷代禮典制度，修改、制定冠服、居室、器用等方面的制度。九日，長時間乾旱。審查囚犯罪狀。
七月十五日，將一些富民遷到京師，以充實都城。十六日，免除京畿內官員的一半田租。八月一日，秦王朱..犯罪，召回京師。九月九日，皇太子巡撫陝西。十一日，都督僉事劉真、宋晟討伐哈梅里，將其擊敗。二十一日，派人出使西域。當月，倭賊攻打雷州，百戶李玉、鎮撫陶鼎戰死。
十月四日，免除北平、河間遭受水災地方的田租。十一月十二日，五開蠻叛亂，都督僉事茅鼎平定叛亂。二十八日，皇太子返回京師，晉王木罔前來朝見。二十九日，賑濟河南水災。十二月十八日，周王木肅返回封地。二十九日，阿資又反，都督僉事何福討伐，降服了阿資。
這一年，天下郡縣賦役黃冊編成，共計一千零六十八萬四千四百三十五戶，五千六百七十七萬四千五百六十一人。琉球、暹羅、別失八里、撒馬兒罕前來朝貢。占城因有篡位之事，拒受其朝貢。
洪武二十五年(1392)一月六日，周王朱木肅前來朝見。二月八日，黃河在陽武決口，徵集軍民堵塞，免除受水災之地的田租。十三日，在南郊隆重祭祀天地。何福平定都勻、畢節諸蠻。十九日，規定死囚，納粟到塞下贖罪。二十日，晉王朱木罔，燕王朱棣、楚王朱楨、湘王朱柏前來朝見。二月七日，召曹國公李景隆等人返回京師。靖寧侯葉升等人在河南及臨、鞏、甘、涼、延慶練兵。都督茅鼎等人平定五開蠻。十五日，耕種耒昔田。二十九日，詔令天下衛所軍隊抽出十分之七屯田。三月二日，馮勝等十四人分別料理陝西、山西，河南諸衛軍務，三月九日，改封豫王朱桂為代王，漢王朱木英為肅王，衛王朱植為遼王。
四月一日，涼國公藍玉出征罕東。二日，建昌衛指揮月魯帖木兒叛亂，被指揮魯毅擊敗。二十五日，皇太子朱標死去。二十七日，都督聶緯、徐司馬、瞿能討伐月魯帖木兒，等藍玉返回，一併受其節制。五月一日，藍玉到達罕東，叛軍逃跑，於是趨兵建昌。九日，賑濟陳州、原武水災。六月十日，西平侯沐英死於雲南。
七月一日，秦王朱..返回封地。四日，指揮瞿能在雙狼寨打敗月魯帖木兒。八月十日，江夏侯周德興連坐被誅。十八日，馮勝、傅友德率領開國公常升等分行山西，籍民為軍。在大同、東勝屯田，建立了十六衛。二十五日，供給王公諸侯每年的俸祿，歸賜田地於官。二十七日，靖寧侯葉升連坐胡惟庸一案被誅。九月十二日，冊立皇孫允火文為皇太孫。高麗李成桂囚禁其主瑤而自立為王，借國人之名上表請命，詔令允奏，改其國號為朝鮮。
十月二十七日，沐春承襲封號西平侯，鎮守雲南。十一月十七日，藍玉擒獲月魯帖木兒，處死，召回藍玉。十二月二十八日，宋國公馮勝、潁國公傅友德等人兼任東宮師保官。閏十二月二十二日，馮勝擔任總兵官，傅友德為副總兵，在山西、河南練兵，兼任領屯衛。
這一年，有琉球、中山、山南、高麗、哈梅里前來朝貢。
洪武二十六年(1393)正月二日，規定天下耆民免朝。十五日，在南郊隆重祭祀天地。二月二日，晉王朱木岡統領山西、河南軍隊出塞，召回馮勝、傅友德、常升、王弼等人。十日，蜀王朱椿來京朝見。涼國公藍玉因為謀反被誅，鶴慶侯張翼、普定侯陳桓、景川侯曹震、舳艫侯朱壽、東莞伯何榮、吏部尚書詹徽等都被連坐誅殺。十四日，頒發逆臣錄於天下。十五日，耕種耒昔田。三月六日，代王朱桂率護衛兵出塞，受晉王節制。長興侯耿炳文在陝西練兵。十一日，馮勝、傅友德守衛山西、北平邊防，其屬衛將校都受晉王、燕王節制。十五日，詔令晉、燕二王，重要軍務要事先奏知。十七日，會寧侯張溫連坐於藍玉一案而被誅殺。
四月一日，孝感發生饑荒，派人開官倉、貸糧賑饑。詔諭自今以後，發生饑荒，先貸後奏，定為制度。十七日，周王朱木肅來京朝拜。十九日，天氣乾旱，要群臣直言其得失，審查監獄的囚犯。二十五日，由於安南擅自廢立君主，拒絕接受其朝貢。
七月一日，日食。五日，選拔秀才張宗..等人跟隨詹事府官到文華殿，侍候皇太孫。八月，秦、晉、燕、周、齊五王前來朝見。九月十一日，代、肅、遼、慶、寧五王來京朝拜。赦免胡惟庸、藍玉餘黨。
十月二十四日，提升國子監生六十四人擔任布政使等官職。十二月，給諸王頒發《永鑑錄》。
這一年，琉球、爪哇、暹羅前來朝貢。
洪武二十七年(1394)正月十五日，在南郊祭祀天地。二十一日，封李景隆為平羌將軍，鎮守甘肅。各地開倉貸糧給貧民百姓。三月一日，封賜張信等人以進士及第和其他不同的出身。二日，魏國公徐輝祖、安陸侯吳傑在浙江防備倭寇。十一日，督促百姓種植桑、棗、木、棉。二十五日，由於四方平定，收藏兵器，表示永不復用。
八月七日，吳傑以及永定侯張銓率領辭官的武將，在廣東防備倭寇。八日，派國子監生前往各地，督促官吏、百姓興修水利。十九日，階、文軍隊叛亂，都督寧正被封為平羌將軍前往征討。九月，徐輝祖節制陝西沿邊各路軍隊。十一月二十九日，潁國公傅友德犯罪被誅。阿資又反，西平侯沐春將其擊敗。十二月，定遠侯王弼犯罪被殺。
這一年，烏斯藏、琉球、緬、朵甘、爪哇、撒馬兒罕、朝鮮來京朝貢。安南前來朝貢被拒絕。
洪武二十八年(1395)正月十日，階、文賊寇平定，寧正率兵跟隨秦王朱..征伐洮州叛番。十二日，在南郊祭祀天地。二十九日，西平侯沐春擒斬阿資，平定越州。當月，周王朱木肅、晉王朱木岡率領河南、山西各衛軍隊出塞，修築城防和屯田。燕王朱棣率總兵官周興出遼東要塞。二月三日，宋國公馮勝犯罪被殺。二十五日，詔諭戶部編民以一百戶為一里。遇婚喪病死以及其他困難，裡中富裕的人幫助錢財，貧窮的人助力。春耕秋收，通力合作，以便百姓和睦。
六月十日，詔令各地土司都要提倡儒學。十九日，周興等人從開原追敵到甫答迷城，沒能趕到，於是返回。二十七日，皇帝在奉天門對群臣說：“我起兵到今天有四十多年了，灼見情偽，懲治奸頑，有時不按法典用刑，這不能長久。以後，只能按照法典與大誥辦事，不許用黥、刺、非刂、劓、閹割等刑罰。對敢請求施酷刑的人要從重處罰。”又說“：我廢除丞相，設定府、部、都察院分管各種事務，大權歸於朝廷。以後的君王不準再設丞相。有為臣的膽敢請求設定，從重處罰。皇親犯謀逆之罪，嚴懲不赦。我，犯法，由宗親會議從嚴制裁。法司只許上奏檢舉，不得擅自捕人。嚴格制定這些典章，永世遵守。”
八月六日，封都督楊文為徵南將軍，指揮韓觀、都督僉事宋成為副將軍，討伐龍州土官趙宗壽。七日，信國公湯和死去。二十日，趙宗壽來朝謝罪，楊文又率兵討伐奉議、南丹叛蠻。九月六日，免除京畿、山東秋糧。十九日，向天下頒發皇明祖訓條章，“後人若有談論更改祖制的，以奸臣論處”。十一月十五日，奉議、南丹蠻都被平定。十二月三日，詔令對河南、山東栽種桑棗以及二十七年(1394)以後新開墾的土地，不要徵稅。
這一年，朝鮮、琉球、暹羅來京朝貢。
洪武二十九年(1396)一月十五日，在南郊祭祀天地。二月十五日，徵虜前將軍胡冕討伐郴、桂蠻，予以平定。二十三日，燕王朱棣率兵巡視大寧，周世子有墩領軍巡視北平關隘。三月四日，楚王朱楨、湘王朱柏入京朝見。七日，燕王朱木肅在徹徹兒山打敗敵軍，又追剿到兀良哈禿城後返回。
八月二十二日，免除應天、太平五府田租。九月二十日，召見辭官的武將二千五百多人，大加賞賜，並加一級俸祿。
這一年，琉球、安南、朝鮮、烏斯藏來京朝貢。
洪武三十年(1397)一月三日，封耿炳文為徵西將軍、郭英為副將軍，巡視西北邊防。十三日，在南郊祭祀天地。十四日，在山西、北平、陝西、甘肅、遼東設定流動的太僕寺，掌管馬匹管事宜。十六日，左都督楊文在遼東屯田。當月，沔縣盜賊起事，詔令耿炳文征討。二月七日，水西蠻叛亂，都督僉事顧成被封為徵南將軍，平定反叛。三月一日，賜封陳安阝等人以進士及第等不同的出身。二十八日，古州蠻反叛，龍里千戶吳得、鎮撫井孚戰死。
四月十七日，都指揮齊讓被封為平羌將軍，前往征討。二十日，平定水西蠻。五月一日，日食。四日，楚王朱楨、湘王朱柏率兵討伐古州蠻。六月一日，封賜禮部覆試貢士韓克忠等人以進士及第等不同的出身。二十九日，駙馬都尉歐陽倫犯罪被賜死。
八月八日，黃河在開封決口。十五日，李景隆被封為徵虜大將軍，在河南練兵。九月一日，漢、沔賊寇被平定。十九日，麓川平緬土酋刀幹孟追隨宣慰使思倫發反叛。二十六日，都督楊文代替齊讓擔任徵虜將軍。
十月十日，停止遼東海運。十三日，耿炳文在陝西練兵。七日，重建國子監先師廟完工。十一月二十五日，沐春為徵虜前將軍，都督何福等人為將軍，討伐刀幹孟。
這一年有琉球、占城、朝鮮、暹羅、烏斯藏、泥八剌入京朝貢。
洪武三十一年(1398)正月十四日，在南郊祭祀天地。十七日，派人到山東、河南督促農耕。二月八日，倭寇攻打寧海，被指揮陶鐸擊敗。二十四日，平定古州蠻，召回楊文。二十七日，都督僉事徐凱平定麼些蠻。
四月四日，廷臣以朝鮮屢生事端為由，請求討伐，未準。五月初一日，沐春大敗刀幹孟。八日，皇上患病。十二日，都督楊文跟隨燕王朱棣，武定侯郭英跟隨遼王朱植，在開平守備，俱受燕王節制。
閏五月八日，皇上病情惡化。十日，駕崩於西宮，終年七十一歲。遺詔說：“我在位三十一年，憂心於天下，日夜操勞，以求有益於民。無奈出身寒微，無古人之博識，揚善懲惡，做得很不夠。現在順其萬物自然的法則，沒有必要哀念。皇太孫允火文英明仁孝，受天下擁戴，應繼承皇位。內外文武大臣要齊心輔佐，以使天下安定。喪禮祭祀所需的東西，不要用金銀器皿。孝陵的山水保持原貌，不要改變。天下臣民，哀悼三天之後，全部脫去孝服，以免影響嫁娶之事。諸王留在封地，不要前往京師。此詔令未說之事，按詔令意思酌情辦理。”十六日，安葬於孝陵。被追封為高皇帝，廟號為太祖。永樂元年(1403)，追封為聖神文武欽明啟運俊德成功統天大孝高皇帝。嘉靖十七年(1538)，進而追封為開天行道肇紀立極大聖至神仁文義武俊德成功高皇帝。
太祖皇帝有天授智勇，統一華夏，文韜武略，為漢、唐、宋各代君主所不及。開始之初，能深藏不露，靜觀變化，戰略順序，成算在胸。曾與各位臣僚談論奪取天下的謀略，說：“我遭遇戰亂，起事於窮鄉僻壤，本來只想保全自己。到渡江以後，看群雄的所作所為，只是使百姓遭受災難，其中張士誠、陳友諒尤為突出。士誠可憑藉財富，友諒憑藉強大，唯獨我沒有依靠。只是不喜殺人，提倡信義，厲行節儉，與各位同舟共濟。起初與張、陳二寇相持，士誠與我更接近，有的人建議要先攻擊他。我認為友諒性格驕狂，士誠器量窄小，性格驕狂則喜歡挑起戰事，器量窄小則沒有遠大抱負，因此要先進攻友諒。鄱陽之戰，士誠軍隊沒有邁出姑蘇一步去進行援救。如果先進攻士誠，浙西憑藉牢固城防堅守，友諒必然率全部兵馬趕來，我就會腹背受敵。除掉二寇，北上平定中原，之所以先攻山東，再進河洛，而停止潼關兵馬不去攻取秦、隴，是因為擴廓帖木兒、李思齊、張思道雖經百餘戰卻勝負未分，急於進攻，他們就會聯合一起抵抗，短期內不能平定他們，因此，出其不意，反而率軍北上。燕都既然攻克，再行西征。張、李勢單力薄，於是不戰而勝，然而擴廓還拼力抵抗。如果不先攻下燕都，就急於與他角逐，勝負就難說了。”太祖皇帝的雄才大略，制勝於敵，可見一斑。因此，他能平息禍亂，取得天下。有道是“後來者居上的道理”豈是偶然的嗎？
評論：太祖憑聰明神武的天資，胸懷濟世安民之志，審時度勢，豪傑景仰，平定戰亂，消除強暴，十五年完成帝業。從一介布衣到基業覆蓋海宇，自西漢以後從未有過。吸取元朝政治廢弛的教訓，整肅政治。而且對耆儒以禮相待，考查制定禮典樂章，彰明經義，尊崇正學，施恩於亡國亡地，澄清吏治，修定做人準則，尊崇風俗宗教，正後宮名義，內治肅清，禁止宦官太監干預政事，五府六部官職互相牽制，設衛屯田，兵器糧食充足。以武平定禍亂，以文建立太平盛世，太祖一身兼有。在崇尚節義方面，允許蔡子英北歸。晚年更加憂民，曾以一年的時間開挖支河數萬處河渠塘堰，以利農桑，預防旱災。憑藉這些，其子孫承襲基業二百多年，士重名義，平民充實。至今後代蒙受恩澤，就如東樓、白馬，世代相傳祭祀太祖，享受這些決不是平白無故的啊！
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